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https://yeast-simulation.vercel.app/
我来简单介绍一下我们的演示软件(科学上网打开)【注意:这就是寒培PK-round3的software,并非新东西】
目前它的主要功能是:用户自行调节氧气浓度和培养温度,可视化地演示酵母的生长
在后期获取更多的湿实验数据后,我们可以添加更多培养条件,使得不同条件的自由耦合,从而更大化地发挥drylab的预测作用,而不仅仅是目前的演示作用。同时酵母作为常用的底盘生物,许多iGEM的队伍都会用到,那么我们的软件可能会为使用酵母的队伍提供一些帮助。
基于Model的学习总结,对Fudan iGEM 2025_Model 提出设想(持续更新)
【本文档仅是设想,还未实际实现;代码仅体现思路,未必能正常运行,有待debug;部分数据为假设值】
对于2025iGEM酵母多细胞体系,我理想中的model会分为以下三个层次:
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第一层次:单细胞到多细胞体系的复现
这一层次的重点是单细胞的生长和分裂,并将其扩展到群体生长,不需要过多关注内部机制,只要能够模拟出实验中酵母从单细胞到多细胞群体的过程,属于演示模型。
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第二层次:预测未知条件下的酵母生长
在第二层次中,可以开始引入更多的环境变量和生物学规律,旨在通过已知的实验数据推测酵母在不同环境条件下的生长行为,演变为预测模型。
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第三层次:虚拟细胞(AIVC)的构建
第三层次是最具挑战性的,旨在构建一个虚拟细胞,能够完整仿真现实中酵母菌的生物学过程。这个层次接近于人工智能领域的虚拟生命,不仅仅是复现实验数据,而是实现全面的仿真。

Fudan University undergraduate student
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Judging
| 1 | How impressive is the modeling? 建模有多令人印象深刻? |
|---|---|
| 2 | Did the model help the team understand a part, device, or system? 该模型是否帮助团队了解部件、设备或系统? |
| 3 | Did the team use measurements of a part, device, or system to develop the model? 团队是否使用零件、设备或系统的测量值来开发模型? |
| 4 | Does the modeling approach provide a good example for others? 建模方法是否为其他人提供了很好的示例? |
